宠物医院污水中含有大量细菌、病毒、寄生虫卵、宠物粪便及有毒有害物质，有的可能含有放射性，而宠物医院一般占地面积小，污水排放量并不大，所以采用占地面积大、工艺复杂、一次投资和运行费用高的传统的污水处理设备工艺不太适合，目前宠物医院污水处理设备工艺一般采用生物接触氧化+沉淀+消毒工艺，即A/O生物脱氮工艺处理。污水中氨氮转换成亚硝态氮、硝态氮，再通过反硝化菌作用把硝态氮转换成氮气，从污水中脱氮。要点是注重污水、污泥的杀菌消毒方式。关键是杀灭病原菌。现在宠物医院污水处理设备一般采用多级过滤+膜处理+消毒工艺，宠物医院污水经格栅清除悬浮物、药棉、纱布及粪便杂物后进入污水调节池。污水调节池内加臭氧消毒，然后经过加压进入粗级过滤器，去除小颗粒，再经过精密高效过滤器，去除超细颗粒，经活性碳吸附去除部分废水中的有机物，再过超滤和RO反渗透膜过滤净化后，可达标排放。